После окончания медицинского института работал врачом-стоматологом-хирургом в стоматологической поликлинике.
За годы врачебной практики прошёл путь от стоматолога-ортопеда и заведующего хирургическим отделением до главного врача ОГАУЗ «Стоматологическая поликлиника №1» города Белгорода.
Особое внимание Иван Овчинников уделяет расширению в регионе сети стоматологических кабинетов. При его участии открылось стоматологическое отделение в микрорайоне Крейда в Белгороде.
Иван Овчинников регулярно проходит курсы повышения квалификации, публикует научные статьи и работает над диссертацией.
По его инициативе на базе Стоматологической поликлиники № 1 г. Белгорода был создан Общественный совет. Одно из направлений его работы – поддержание и стимулирование одарённых детей сотрудников поликлиники, создание благоприятных условий для раскрытия способностей ребёнка, повышение творческой активности и социализации.