Н.А. Пономарева осуществляет активную научную работу, которую сочетает с активной практической деятельностью. С 1986 года работает в КГМУ на кафедре акушерства и гинекологии.
Защитила кандидатскую диссертацию по теме: "Профилактика, прогнозирование патологической послеродовой кровопотери" под руководством Ерещенко Н.А., а также докторскую диссертацию по теме: "Профилактика, диагностика и лечение перинатальных гипоксически-ишемических повреждений" под руководством Газазян М.Г.

Имеет более 300 научных работ, опубликованных в местной, центральной и зарубежной печатях. Авторский вклад в научной работе: 9 патентов на изобретение. Руководитель 4 кандидатских диссертаций своих учеников.

Н.А. Пономарева - член Российского общества акушеров - гинекологов, член Курского областного отделения Общероссийской общественной организации «Российское общество специалистов по профилактике и лечению опухолей репродуктивной системы».
Надежда Анатольевна - обладатель почетного звания "Ветеран КГМУ".
Награждена почетной грамотой Курского городского Собрания, нагрудным знаком «Отличник здравоохранения», нагрудным знаком "Изобретатель СССР".