По окончании обучения в 1987 году была принята в очную аспирантуру. В 1992 г. защитила диссертацию «Флуориметрическое определение фенола и фенолсодержащих лекарственных средств» на соискание ученой степени кандидата фармацевтических наук. Елена Вячеславовна продолжила работу по развитию и совершенствованию использования флуоресцентного метода в анализе лекарственных средств и в 2001 г защитила докторскую диссертацию «Флуоресцентный анализ лекарственных соединений, содержащих фенольный гидроксил». С 1992 г Елена Вячеславовна ведет научно-педагогическую деятельность. Сначала в должности ассистента кафедры фармацевтической химии, затем ассистента и старшего преподавателя кафедры аналитической и токсикологической химии, профессора кафедры фармацевтической, токсикологической и аналитической химии. В настоящее время она заведует кафедрой общей и биоорганической химии.

Профессор Будко Е.В. является автором и соавтором более 200 публикаций и патентов по вопросам анализа лекарственных средств и педагогической работы. В настоящее время под ее руководством ведутся многолетние научные работы студентами и молодыми учеными по тематикам фармакологической активности неорганических соединений и их комплексов, Ведется работа над новыми диссертациями.

В течении десяти лет Елена Вячеславовна является председателем предметной комиссии регионального тура Всероссийской олимпиады школьников по химии, организует проведение регионального тура Всероссийской олимпиады по химии для школьников. В 2013 году являлась членом Жюри заключительного этапа 49-й Всероссийской олимпиады школьников по химии. Профессор Будко Е.В. принимает активное участие в работе Центра довузовской подготовки и профориентации КГМУ, в работе с одаренными детьми по инициативе Комитета образования и науки Курской области. Награждена почетными грамотами Администрации города Курска и комитета образования и науки Курской области.

Материал подготовлен на основе информации из открытых источников.